En fonction de l'environnement du refuge, les prédateurs sauvages d'un jardin d''oiseaux peuvent êtres les écureuils, les rapaces, les pies, les rats et les renards. Les écureuils, et les pies peuvent s'emparer des œufs dans le nid et même des poussins. L'accès à une mangeoire placée sur un poteau métallique posera problème à un mammifère. Les faucons, les éperviers se nourrissent de petits oiseaux. Pour ces raisons installez les nichoirs le plus à l'abri possible. Même un pic épeiche peut s'attaquer à une couvée en détruisant la façade du nichoir pour s'emparer de la portée. Une seule solution s'impose alors : renforcer le nichoir avec une plaque métallique. Les rats sont aussi des pilleurs de nid, et en plus ils sont vecteur de la salmonellose. Il est donc important de bien nettoyer le site afin d'éviter de les attirer.
